В 1986  году открыто колопроктологическое отделение КОКБ на 60 коек, которое воглавляла  заслуженный врач  РФ В.Н. Ананьичева. На современном этапе функционирует отделение на 35 коек. В отделении  работают 7 врачей – специалисты высшей и первой категорий.

Заведует отделением  врач высшей квалификационной категории Владимир Борисович Шуклин.

         В отделении выполняются общеколопроктологические, онкологические операции на прямой и ободочной кишке, малоинвазивные хирургические пособия, а также сложные пластические и реконструктивно-восстановительные вмешательства.

         Ежегодно в отделении получают высококвалифицированную помощь свыше 1030 больных, проводится до 1120 операций.

         Приоритетными направлениями научно-клинической работы являются: совершенствование сфинктеросохраняющих и органосберегающих операций на прямой кишке при онкопатологии, пластических, восстановительных и реконструктивных операций, хирургическая реабилитация больных с колостомами, применение трансанальных эндоскопических операций при ворсинчатых опухолях прямой кишки и начальных стадий колоректального рака, проведение методик с использованием современных энергетических установок, сшивающих аппаратов.

         В перспективе – внедрение лапроскопических и микрохирургических технологий, в комплексном лечении заболеваний прямой и ободочной кишки.